系团总支在院团委、院学生处和系党支部的领导下开展本系共青团的工作和学生工作，主要职责如下：
1、组织团员青年学习党的路线、方针、政策，有针对性地抓好政治理论学习、形势任务教育和基础文明建设，不断提高团员的思想政治素质，引导团员青年树立正确的世界观，人生观和价值观，充分发挥团员的模范带头作用。
2、根据系党支部和院团委、院学生处的工作部署，提出学期或年度计划，认真落实并及时总结。
3、配合系党支部做好学生的日常教育和管理工作，协助处理学生学习生活中出现的问题。关心团员青年的思想、学习和生活，围绕教育、教学中心工作，深入调查研究，了解团员青年的思想动态，调查研究青年工作中的实际问题，及时向上级反映青年学生的意见和要求，并提出解决问题的建议。努力做好院系联系团员青年的桥梁和纽带。
4、搞好团支部组织建设，严格团的组织生活，健全团内“三会一课”制度。领导各班团支部开展活动，定期召开团支部书记例会，传达上级指示，布置、讨论、总结和改进团的工作，每月检查各团支部工作。指导系学生会分会工作、协助班主任指导班委会工作。协调团支部与班委会的工作关系。及时向上级汇报工作。
5、加强团总支自身建设，健全团的组织生活制度。本着培养、提高的原则，加强团干部队伍的建设，并注重对学生干部的培养和考核。
6、做好优秀团支部、优秀团员、优秀团干部等评比工作，做好团员证的管理、发展新团员、团员情况统计等工作，
7、负责团内纪律监察，对本系违反团纪的团员进行批评教育和向院团委提出处分意见。
8、配合党支部做好党员发展工作，对于入党积极分子进行培养、 教育、考察，做好“推优”工作。
9、组织开展校园文化、特色活动、社会实践活动和形式多样的社团活动，丰富和活跃学生业余生活，促进健康、文明的系风和校风的形成。配合管理人员搞好公寓管理，加强公寓文化建设。
10、指导和帮助系学生社团依照各自章程，积极主动地开展工作，支持院学生会和学生社团的工作。
